Protein–RNA interactions for Protein: A2AGH6

Med12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 2,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med12A2AGH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med12A2AGH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med12A2AGH6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med12A2AGH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med12A2AGH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med12A2AGH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med12A2AGH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med12A2AGH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms