Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Itgb4A2A863 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Itgb4A2A863 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Itgb4A2A863 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Itgb4A2A863 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Itgb4A2A863 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Itgb4A2A863 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Itgb4A2A863 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Itgb4A2A863 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Itgb4A2A863 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Itgb4A2A863 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Itgb4A2A863 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Itgb4A2A863 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Itgb4A2A863 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms