Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RlfA2A7F4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,54■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
RlfA2A7F4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
RlfA2A7F4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
RlfA2A7F4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
RlfA2A7F4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
RlfA2A7F4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
RlfA2A7F4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
RlfA2A7F4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RlfA2A7F4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,3 ms