Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdr2lA2A6T1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdr2lA2A6T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdr2lA2A6T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdr2lA2A6T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdr2lA2A6T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdr2lA2A6T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdr2lA2A6T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdr2lA2A6T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdr2lA2A6T1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdr2lA2A6T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdr2lA2A6T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdr2lA2A6T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdr2lA2A6T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms