Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krtap29-1A2A5X4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap29-1A2A5X4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap29-1A2A5X4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap29-1A2A5X4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap29-1A2A5X4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krtap29-1A2A5X4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krtap29-1A2A5X4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms