Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkd2l1A2A259 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkd2l1A2A259 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l1A2A259 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l1A2A259 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l1A2A259 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l1A2A259 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l1A2A259 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkd2l1A2A259 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms