Protein–RNA interactions for Protein: A0A504

Smim17, MCG116182, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim17A0A504 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smim17A0A504 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim17A0A504 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim17A0A504 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim17A0A504 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim17A0A504 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim17A0A504 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim17A0A504 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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