Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SR87

1810010D01Rik, RIKEN cDNA 1810010D01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810010D01RikA0A1L1SR87 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1810010D01RikA0A1L1SR87 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810010D01RikA0A1L1SR87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810010D01RikA0A1L1SR87 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810010D01RikA0A1L1SR87 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810010D01RikA0A1L1SR87 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1810010D01RikA0A1L1SR87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810010D01RikA0A1L1SR87 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1810010D01RikA0A1L1SR87 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms