Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms