Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf346Q9R0B7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf346Q9R0B7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms