Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem54Q9D7S1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem54Q9D7S1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms