Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms