Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CARD11Q9BXL7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms