Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VN1R3Q9BXE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms