Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX50Q9BQ39 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX50Q9BQ39 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms