Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms