Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRELD1Q96HD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms