Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms