Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MALSU1Q96EH3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms