Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNMA8AQ86V59 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNMA8AQ86V59 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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