Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms