Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIG3Q6UXM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms