Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bnip1Q6QD59 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms