Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim28Q62318 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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Trim28Q62318 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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Trim28Q62318 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim28Q62318 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim28Q62318 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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