Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Nfe2l1Q61985 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Nfe2l1Q61985 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2l1Q61985 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Nfe2l1Q61985 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nfe2l1Q61985 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms