Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF123Q5XPI4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF123Q5XPI4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms