Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf50Q5SZB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf50Q5SZB4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms