Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDO1Q16878 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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