Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B3Q16720 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B3Q16720 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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