Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK7Q16549 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK7Q16549 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK7Q16549 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK7Q16549 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCSK7Q16549 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK7Q16549 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK7Q16549 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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PCSK7Q16549 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
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PCSK7Q16549 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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PCSK7Q16549 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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PCSK7Q16549 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK7Q16549 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK7Q16549 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK7Q16549 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK7Q16549 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK7Q16549 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK7Q16549 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK7Q16549 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
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