Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TUBB3Q13509 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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