Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD4Q13485 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD4Q13485 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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