Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 AIM6YDL237W 1173 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SHU2YDR078C 672 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 HTA1YDR225W 399 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YGR168CYGR168C 1131 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 HSP10YOR020C 321 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RPN8YOR261C 1017 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YBR116CYBR116C 528 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RPO41YFL036W 4056 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 PHO2YDL106C 1680 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 DUG2YBR281C 2637 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 VPS41YDR080W 2979 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDL186WYDL186W 834 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RNH202YDR279W 1053 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SAW1YAL027W 786 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 EMC2YJR088C 879 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 GLO1YML004C 981 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 ATG16YMR159C 453 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RPS10BYMR230W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 UAF30YOR295W 687 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 snR43snR43 209 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 TMA64YDR117C 1698 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 STE24YJR117W 1362 nt2.72□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SAD1YFR005C 1347 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YNL011CYNL011C 1335 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RRT13YER066W 558 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 PPE1YHR075C 1203 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YLR042CYLR042C 486 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 TFB6YOR352W 1032 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YOR385WYOR385W 873 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 PET20YPL159C 762 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YPL276WYPL276W 438 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 HUL5YGL141W 2733 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YKR015CYKR015C 1707 nt2.71□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 CWH41YGL027C 2502 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YCL076WYCL076W 744 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YCR016WYCR016W 873 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YDR124WYDR124W 975 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 BAT1YHR208W 1182 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 ATG27YJL178C 816 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RSM26YJR101W 801 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 MTG1YMR097C 1104 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 MRPS8YMR158W 468 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RRG8YPR116W 834 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 SEC26YDR238C 2922 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 PFF1YBR074W 2931 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 FKS3YMR306W 5358 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 PTP3YER075C 2787 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 FIR1YER032W 2631 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YML096WYML096W 1578 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 SKO1YNL167C 1944 nt2.7□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RDS2YPL133C 1341 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RAD55YDR076W 1221 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YGR293CYGR293C 462 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RNR2YJL026W 1200 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 POP8YBL018C 402 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 ATG19YOL082W 1248 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YBL108WYBL108W 306 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 THI80YOR143C 960 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 CAF20YOR276W 486 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 NSA1YGL111W 1392 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 BEM4YPL161C 1902 nt2.69□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 AVT2YEL064C 1443 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YGR067CYGR067C 2415 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RPB9YGL070C 369 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 ARI1YGL157W 1044 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 SNX4YJL036W 1272 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 HOT13YKL084W 351 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YLR257WYLR257W 966 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YML090WYML090W 387 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 EAF7YNL136W 1278 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YBL096CYBL096C 309 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 SUT2YPR009W 807 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 HAP4YKL109W 1665 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 RRP14YKL082C 1305 nt2.68□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YDL050CYDL050C 372 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YDR491CYDR491C 492 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YEL057CYEL057C 702 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YGR073CYGR073C 372 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 DCG1YIR030C 735 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 PAU23YLR037C 375 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 NNT1YLR285W 786 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.67□□□□□ -1.98
CLP1Q08685 YIP3YNL044W 531 nt2.67□□□□□ -1.98
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