Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK4P57078 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RIPK4P57078 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK4P57078 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK4P57078 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms