Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP98P52948 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP98P52948 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NUP98P52948 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP98P52948 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP98P52948 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP98P52948 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP98P52948 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms