Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psen1P49769 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psen1P49769 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psen1P49769 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms