Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A5P29400 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A5P29400 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A5P29400 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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