Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms