Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN2P17706 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPN2P17706 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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