Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra6P16305 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms