Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb2P0C1T1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms