Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Saa1P05366 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa1P05366 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms