Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYBBP04839 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYBBP04839 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYBBP04839 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms