Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3O43889 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CREB3O43889 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CREB3O43889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms