Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRTM2O43300 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRTM2O43300 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms