Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NJR5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NJR5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NJR5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NJR5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NJR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NJR5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NJR5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms