Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC69A6NI79 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC69A6NI79 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms