Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP17L4A6NCW7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L4A6NCW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms