Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr4Q9Z1L2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr4Q9Z1L2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms