Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDY1Q9Y6F8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms